制動系統與安全保護是風力發電機組安全運行的保證。制動系統在機械上主要由氣動剎車和盤式高速剎車兩部分構成。
    控制系統根據風力發電機組發生故障的種類判斷分別進行報警、正常停機、安全停機以及緊急停機等處理，同時針對可自復位故障和不可自復位故障實現風電機組重新自動啟動或人工啟動。
    獨立于計算機的安全鏈是采用反邏輯設計，將可能對風力發電機組造成致命傷害的超常故障如計算機系統失控等串聯成一個回路，一旦其中一個動作，將引起緊急停機，系統失電。
    緊急停機發生后，需人工復位操作后才能重新啟動。